Le tecnologie per la ricerca traslazionale sviluppate recentemente ci danno la possibilità di comprendere più a fondo i meccanismi di una malattia, generando grandi quantità di dati clinici e molecolari.
Questa possibilità di conoscenza dipende da un processo di analisi e integrazione cui vanno sottoposti questi BigData, naturalmente eterogei e spesso provenienti da popolazioni di pazienti molto numerose.
Per soddisfare il crescente bisogno di efficaci soluzioni informatiche di supporto, il centro di ricerca i2b2 – Informatics for Integrating Biology and the Bedside dell’Università di Harvard, Boston (www.i2b2.org, sovvenzionato dal NIH)ha sviluppato una soluzione di eccellenza: i2b2.
I2b2 è un software open source basato su una data-warehouse, in grado di integrare e sfruttare tutti i dati provenienti dalla pratica clinica e dai ricoveri ospedalieri, mettendoli a disposizione e facilmente accessibili ai ricercatori. Oggi l’ambiente i2b2 è installato in centinaia di centri clinici, e gestisce dati di più di cento milioni di pazienti. I2b2 rappresenta la base del programma per la medicina di precisione fondato dal governo Obama negli Stati Uniti d’America.
Il Laboratorio di Informatica BioMedica “Mario Stefanelli” (BMI) è un partner accademico del progetto i2b2 dal 2008, ed ha implementato la piattaforma i2b2 a supporto di molti progetti di ricerca traslazionale in tutti i centri clinici di Pavia.
- IRCCS “C. Mondino National Institute of Neurology” Foundation, Pavia, Italy
- Lab. Experimental Neurobiology (2009)
- IRCCS Fondazione Policlinico San Matteo, Pavia, Italy
- Dep. Transfusion Medicine (2010)
- Dep. Hematology Oncology (2015)
- IRCCS Fondazione Salvatore Maugeri, Pavia, Italy
- Dep. Cardiology rehabilitation (2012)
- Oncology Unit (2011)
- Hospital Information System (2016)
L’ Università degli Studi di Pavia ha anche implementato piattaforme di supporto i2b2 in altri ospedali italiani:
- IRCCS Centro cardiologico Monzino, Milano, Italy – Intensive Care Unit (2011)
- IRCCS Fondazione Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico, Milano, Italy – HIS (2016)
e per la parte di integrazione dati di vari progetti europei:
- FP7-INHERITANCE (La Coruña – Spain) – Cardiomyopathies (2011)
- IMI-SUMMIT (Lund, Sweden) – Cardiovascular complications (2013)
- FP7-MOSAIC(ASL and FSM Pavia, Valencia, Athens-GR) – Diabetes (2015)
Da questo bagaglio di esperienze è partita BIOMERIS la Spin-Off accademica dell’ Università degli Studi di Pavia, e partner ufficiale della i2b2 Foundation.
Dal 2012 BIOMERIS fornisce servizi professionali di implementazione personalizzata di ambienti i2b2 nelle istituzioni sanitarie dell’UE.